神通的直接原因是禪定，尤其是四禪；禪定的直接原因又是戒律，故總的來說，戒律是神通的間接原因，戒律將在下一部分作明確的說明。以有禪定故，能發五神通，如論 (《瑜伽》卷33 ) 云：
依靜慮等，能引無想定及發五神通等。
為什麼有了禪定或靜慮之後就能夠神通自在呢？這在論中解釋「是何因緣要把神足命名為神足」時，有明確的答覆：
問：何因緣故說名神足？答：如有足者，能往能還，騰躍勇健，能得能證世間所有殊勝之法。世殊勝法，說名為神。彼能到此，故名神足。如是若有如是諸法，有三摩地圓滿成辨，彼心如是清淨鮮白，無諸瑕穢，離隨煩惱，安住正直，有所堪能，獲得不動，能往能還，騰躍勇健，能得能證出世間法。由出世法最勝自在。是最勝神，彼能證此，故名神足。
「清淨鮮白」這個詞，瑜伽師使用的頻率相當高，大抵在描述行者依奢摩他的修習而使心的汙染越來越少，心的染汙越少，心原本的光明潔白就被動性地彰顯出來了，這叫做「清淨鮮白」。事實上，心的清淨鮮白、無諸瑕穢、離隨煩惱、安住正直、有所堪能、獲得不動……等等特質相輔相成，．．．瑜伽師除了把「五通」視為「增上正法」，在修學上，也要像解脫道的修法一樣，都要按著聞思修的次第來進行，上面的引文呈現底下的次第關係：
聽聞受持五通增上正法 → 作意思惟五神通 → 修習多修習 → 證得五神通
這完全就是聞思修的次第，神通在這裡呈現出明朗的一面，許多人把神通給神祕化、把它當作神祕主義，完全是無知的表現。神通自始至終就是依著次第道而修得，完全合理，哪有一絲一毫的神祕色彩呢？或許是因為神通之修證處於佛陀教法非主流的部分。主流的分類總以聲聞道或菩提道的教法為主，因此，神通在被忽視的情況下，才漸漸走向神祕，否則，它自身一點都不神祕。
行者在聽聞神通教法後，如何作意思惟呢？必須思惟十二種想，論云：
一輕舉想、二柔軟想、三空界想、四身心符順想、五勝解想、六先所受行次第隨念想、七種種品類集會音聲想、八光明色相想、九煩惱所作色變異想、十解脫想、十一勝處想、十二遍處想。
一般而言，「想蘊」是被除遣的對像，
但在修神通時，「想蘊」扮演了相當重要的角色，它促使神通得以開發。因此，任何事物沒有絕對的好或絕對的壞，事情的好壞對錯依時空、場合……等等因緣而定。底下就根據經文對一一的「想」作大意式的解釋。
一、 輕舉想：想像麤重的身體變成棉絮或風那樣的輕，經過不斷地勝解作意後，能夠使身體飄浮起來，比如從床上飄到桌上，復從桌上飄到床上。
二、 柔軟想：此想可視作輕舉想的增長廣大，把身體作「如毛般」的勝解作意。
三、 空界想：依著前二想的基礎後，身體已能飛行，然若飛行時有障礙物，可能傷害到行者，故於飛行時，對所有的「色」作空勝解，就能飛行無礙。
四、 身心符順想：在《阿姜曼尊者傳》中，有一次阿姜曼從二禪正受退出時，瞬間感到身體的麤重是一大痛苦，因為在二禪中，心已達色界，故欲界之身影響不及，但出定後，心回到欲界，心再度受到身麤重的影響，因而感受到麤重之苦。身心符順想就是在刻服這一困擾，如果心情不愉快而造成心理麤重時，行者必須作「心符順於身」的勝解；相反的，若身體有病苦或麤重燥擾，必須作「身符順於心」的勝解。不斷地作此勝解後，身心將輾轉地越變越輕、柔軟、堪任、光潔，這麼一來，神通就能更加自在了，因為外在皆繫屬於心，依心而轉。
五、 勝解想：訓練自己的想蘊，使能達到具體化、明確化，如使遠的概念轉成近的概念，並使之清晰不模糊；同理也能使近的概念轉成遠的概念，麤細、地水……等等亦復如是。此想成就後，轉變色或聲音將更得心應手。
以上五想若能串習熟練，能領受種種的妙神通境，底下原文的描述是許多佛經在述說神通時所同樣會出現的描述：
由此五想修習成滿，領受種種妙神境通，或從一身示現多身，謂由現化勝解想故；或從多身示現一身，謂由隱化勝解想故；或以其身於諸牆壁垣城等類厚障隔事，直過無礙，或於其地出沒如水，或於其水斷流往返，履上如地，或如飛鳥結加趺坐，騰颺虛空，或於廣大威德勢力日月光輪，以手捫摸，或以其身乃至梵世自在迴轉，當知如是種種神變，皆由輕舉、柔軟、空界身心符順想所攝受勝解想故。
種種神通之境皆是由於修習輕舉、柔軟、空界身心符順想後所生之功德，比如空界身心符順想能使行者於諸牆壁通過無礙，何以故？因為此想不僅要有內在之空性智慧，並使內在的空性智慧向外在世界擴張，使所有的內在與外在都能普遍性地符順於空性，如此一來，在內外達成一致條件下，行者能對內在作種種的轉變，當然也能對外在作種種的轉變，以內外已成一致故。
六、 先所受行次第隨念想：此想是「宿命通」的基礎，然而此想的修習過程，論中並沒有說清，只就此想所生之果而論說。先從今世修起，從孩童時代至今皆能回憶無礙，以此基礎再往前推溯，即能對過去世行住坐臥的種種行憶念了知。修習久後，更能回憶無量的過去世，此回憶說，頗似 Plato 的說法，唯 Plato 的觀念完全與佛教不同。
七、 種種品類集會音聲想：此想是「天耳通」的基礎，令想蘊遍於所有的城鎮、村落與所有種類的音聲，善取其音相，人間天耳成就後，復可對天人之聲取相，則最後能聽取任何一層天的聲音，所有人間天上、遠近的聲音，都能隨意而聽。
八、 光明色相想：此想是「天眼通」的基礎，行者應取光明的色相，於彼作意思惟，不僅於器世間之物相作意，亦於有情之相作意，如此一來，所修得之天眼不僅能看到任何遠近之物，也能看到諸有情類「生從何來、死往何去」的情形。
九、 煩惱所作色變異想：此想是「他心通」的基礎，行者必須於諸有情種種可能生起的煩惱相，解了分別。如有貪者，其外之色相會隨其貪心而呈現各種變化，如諸根躁擾、諸根掉舉、言常含笑；瞋恚者則常現出面貌顰蹙、語音謇澀、言常變色；愚癡者則常現出瘖啞、事義闇昧、言不辯了、語多下俚；此外還有許多種類的心會產生種種相，行者皆須一一解了分別，串習久後，即能獲得「心差別智」，對他人的心理變化便瞭若指掌。
十～十二、瑜伽師將剩餘的三想一起解釋，即第十解脫想、第十一勝處想、第十二遍處想，瑜伽師僅說「如前三摩呬多地」，＜三摩呬多地＞屬於十七中的第六地，＜聲聞地＞則是第十三地，因此要到＜三摩呬多地＞才能找到這三種想的內容。所謂的「解脫想」指的是八解脫，「勝處想」指八勝處，「遍處想」指十遍處。
